A conservação dos recursos hídricos na sub-bacia do rio Ivinhema é a principal preocupação dos municípios da região. Das águas que correm pelos córregos e rios dependem grandes monoculturas, criações de gado de corte, suinocultura e avicultura. De acordo com o coordenador do Programa Pantanal em MS, Valmir Gabriel Ortega, a qualidade da água no município de Dourados, onde ficam as nascentes do Ivinhema, pode ficar comprometida. Uma preocupação bem concreta é que 80% da população local consome a água do rio Dourados. - Se houvesse um acidente com produtos agrotóxicos no rio seria um desastre, diz Valmir Ortega. O intenso desmatamento da vegetação ciliar, que antes servia como uma barreira que continha parte dos agrotóxicos trazidos pela chuva, foi acelerado nos últimos cinco anos. E a poluição pelo esgoto sem tratamento são as principais ameaças às nascentes da sub-bacia. Do outro lado, na parte mais baixa do Ivinhema, a prefeitura de Nova Andradina também chama atenção para a criação de gado. Caracterizada pelo solo arenoso e como uma das maiores produtoras de carne bovina de MS, a cidade já registra extensas erosões em córregos e rios causadas pelo trânsito do gado. Para a diretora do Departamento de Desenvolvimento Agropecuário de Nova Andradina, Verane Silva Surek, o que está causando a erosão não é a criação de gado de corte, mas seu mal manejo.