Em 2004, o Departamento de Recursos Hídricos (DRH) da Sema prossegue a elaboração de estudos das bacias hidrográficas dos Tramandaí e Pardo e do Lago Guaíba, e deve iniciar a formulação de dois novos planos. O Departamento de Florestas e Áreas Protegidas (Defap) vai trabalhar na delimitação e implantação das infra-estruturas de 11 unidades de conservação, envolvendo as comunidades regionais no cuidado destes locais. O Programa Pró-Guaíba prevê a conclusão das metas físicas do seu Módulo I e a elaboração de projetos a serem executados na segunda etapa. Outro objetivo da Sema em relação a este programa se refere à criação da Agência das Águas da Região Hidrográfica do Guaíba, órgão de suporte político, técnico e financeiro do trabalho. Já o Programa Pró-Mar-de-Dentro vai passar a integrar o Sistema Estadual de Recursos Hídricos, retomando a representatividade da comunidade da Zona Sul do Estado no seu desenvolvimento.