Um problema que preocupa a Comissão de Segurança e Saúde Ocupacional do HPS de Porto Alegre são os acidentes com material biológico (sangue, urina, saliva etc). Levantamento da equipe da administradora Márcia Brasil, da enfermeira Fabiane Steffens e do técnico em segurança do trabalho Dagoberto Lorenzo, entre junho de 1999 a maio de 2000, constatou 153 acidentes dessa natureza no hospital. A falta de experiência pode ter sido uma das principais causas desses acidentes, pois 38% a 55% das pessoas que neles incorreram eram servidores que desenvolviam atividades no HPS há menos de seis meses. O número de acidentados é maior na faixa etária de 20 a 29 anos (41,1%) do que na faixa de 30 a 39 anos (18,9%), o que corrobora a tese da importância da experiência. O estudo mostrou também que a incidência de acidentes é maior entre enfermeiros (35,3%) do que entre estudantes de medicina (33,3%) provavelmente porque os enfermeiros passam mais tempo do que os estudantes junto aos pacientes.