Impedir a mudança no Código Florestal proposta pelo deputado Moacyr Micheletto (PMDB-PR) foi outro ponto destacado nas ações do Greeenpeace no Brasil em 2001. Segundo a Ong, as mudanças propostas permitiriam aumentar o desmatamento em todos os ecossistemas brasileiros - Floresta Amazônica, Mata Atlântica e cerrados. A reação do Greenpeace e das demais entidades ambientalistas fez com que a proposta, embora aprovada na comissão parlamentar mista, não seguisse para votação final no Congresso. Outra vitória contabilizada pela Ong foi o cancelamento, por parte do governo federal, de todos os Planos de Manejo de Mogno em operação na Amazônia. A decisão foi motivada pelas denúncias do Greenpeace de operações ilegais de madeireiras na região.